正德十六年,因父老且病上疏归省。明年丁父忧,辟稽山书院,招收绍属八邑及湖广、直隶、南赣等地300余人入学听讲,绍兴知府南大吉也拜在门下。嘉靖四年(1525),服满,御史交章论荐,皆不报。五年,门人日增,又在城西光相桥之东立阳明书院,提倡“心学”,称“心是天地万物之主”,“心即理,心外无理,心外无物”,以为“良知”即天理,“致吾心良知之天理于事事物物,则事事物物皆得其理矣”,因而主张“存天理,去人欲”。其学说比程朱理学空谈“天理性命”更简单易行,故其学一度风靡于南北二都,学者翕然信从。还提出“知行合一”,认为“知是行之始,行是知之成”,“知之,真切笃实处便是行”,“一念发动处,便即是行了”。主张教育儿童要顺应其性情,反对强迫、惩罚,“必使其趋向鼓舞,中心嘉悦,”以“达到自然日长日化。”嘉靖六年,思恩、田州土酋卢苏、王受反,诏守仁以原官,赐铁券岁禄,兼都察院左都御史,总督两广及江西、湖广军务,抚剿广西田州等地少数民族起义;七年,招降田州卢苏、王受等,即以降人攻破断藤峡八寨之瑶、壮等族起义军。是年冬,守仁病甚,疏乞骸骨,不俟命竟归,行至南安卒,年57岁,归葬于山阴西南花街洪溪(今兰亭镇花街村)。守仁既卒,桂萼奏其擅离职守,帝大怒,下廷臣议,诏停世袭,恤典俱不行。隆庆(1567~1572)初,廷臣多颂其功,诏赠新建侯,谥文成。王守仁墓于1991年由日本“王学”研究者出资日元300万重修,现为省级文物保护单位。
《明史》评:“终明之世,文臣用兵制胜,未有如守仁者。”王守仁学宗陆九渊。现存《王文成公全书》38卷。其中《传习录》、《大学问》为其主要哲学著作,世称陆王心学,或称“阳明学”。约在明代中期以后,传入日本、朝鲜和东南亚各国,颇有国际影响。《明史》有传。